Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms