Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp12Q9D9M2 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms