Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Cnot8Q9D8X5 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Cnot8Q9D8X5 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Cnot8Q9D8X5 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Cnot8Q9D8X5 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot8Q9D8X5 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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