Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp4bQ9D8B3 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms