Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ttc9bQ9D6E4 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc9bQ9D6E4 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms