Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ccdc7Q9D541 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ccdc7Q9D541 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ccdc7Q9D541 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ccdc7Q9D541 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ccdc7Q9D541 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ccdc7Q9D541 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ccdc7Q9D541 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ccdc7Q9D541 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ccdc7Q9D541 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc7Q9D541 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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