Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc130Q9D516 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc130Q9D516 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms