Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rufy3Q9D394 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms