Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

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Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fndc8Q9D2H8 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fndc8Q9D2H8 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fndc8Q9D2H8 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fndc8Q9D2H8 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fndc8Q9D2H8 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fndc8Q9D2H8 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fndc8Q9D2H8 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fndc8Q9D2H8 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fndc8Q9D2H8 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Fndc8Q9D2H8 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Fndc8Q9D2H8 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Fndc8Q9D2H8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Fndc8Q9D2H8 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Fndc8Q9D2H8 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Fndc8Q9D2H8 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Fndc8Q9D2H8 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Fndc8Q9D2H8 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Fndc8Q9D2H8 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Fndc8Q9D2H8 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Fndc8Q9D2H8 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Fndc8Q9D2H8 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
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