Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syf2Q9D198 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms