Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms