Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc47Q9D024 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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