Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZG3

Commd8, COMM domain-containing protein 8, mousemouse

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd8Q9CZG3 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Commd8Q9CZG3 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms