Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Snx7Q9CY18 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Snx7Q9CY18 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Snx7Q9CY18 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Snx7Q9CY18 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Snx7Q9CY18 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Snx7Q9CY18 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Snx7Q9CY18 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Snx7Q9CY18 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Snx7Q9CY18 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Snx7Q9CY18 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Snx7Q9CY18 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Snx7Q9CY18 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms