Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT8

Pmpcb, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mousemouse

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Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcbQ9CXT8 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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PmpcbQ9CXT8 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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PmpcbQ9CXT8 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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PmpcbQ9CXT8 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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PmpcbQ9CXT8 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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PmpcbQ9CXT8 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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PmpcbQ9CXT8 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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PmpcbQ9CXT8 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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PmpcbQ9CXT8 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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PmpcbQ9CXT8 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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PmpcbQ9CXT8 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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PmpcbQ9CXT8 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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PmpcbQ9CXT8 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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PmpcbQ9CXT8 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PmpcbQ9CXT8 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms