Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Exo5Q9CXP9 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Exo5Q9CXP9 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Exo5Q9CXP9 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Exo5Q9CXP9 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms