Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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Utp23Q9CX11 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Utp23Q9CX11 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Utp23Q9CX11 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Utp23Q9CX11 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Utp23Q9CX11 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms