Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RpainQ9CWY9 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RpainQ9CWY9 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RpainQ9CWY9 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RpainQ9CWY9 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RpainQ9CWY9 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RpainQ9CWY9 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RpainQ9CWY9 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RpainQ9CWY9 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RpainQ9CWY9 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RpainQ9CWY9 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RpainQ9CWY9 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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