Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Rpusd4Q9CWX4 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Rpusd4Q9CWX4 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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