Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms