Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rprd1bQ9CSU0 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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