Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg12Q9CQY1 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms