Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rdm1Q9CQK3 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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