Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
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