Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Commd4Q9CQ02 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Commd4Q9CQ02 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Commd4Q9CQ02 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Commd4Q9CQ02 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Commd4Q9CQ02 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Commd4Q9CQ02 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Commd4Q9CQ02 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Commd4Q9CQ02 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Commd4Q9CQ02 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Commd4Q9CQ02 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Commd4Q9CQ02 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Commd4Q9CQ02 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Commd4Q9CQ02 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Commd4Q9CQ02 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms