Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms