Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Mrpl3Q99N95 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
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Mrpl3Q99N95 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Mrpl3Q99N95 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Mrpl3Q99N95 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl3Q99N95 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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