Protein–RNA interactions for Protein: Q99N92

Mrpl27, 39S ribosomal protein L27, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl27Q99N92 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl27Q99N92 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms