Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd1Q99MV1 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd1Q99MV1 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd1Q99MV1 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd1Q99MV1 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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Tdrd1Q99MV1 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd1Q99MV1 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd1Q99MV1 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd1Q99MV1 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd1Q99MV1 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd1Q99MV1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd1Q99MV1 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd1Q99MV1 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd1Q99MV1 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd1Q99MV1 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd1Q99MV1 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Tdrd1Q99MV1 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd1Q99MV1 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd1Q99MV1 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd1Q99MV1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd1Q99MV1 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd1Q99MV1 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd1Q99MV1 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tdrd1Q99MV1 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tdrd1Q99MV1 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tdrd1Q99MV1 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Tdrd1Q99MV1 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tdrd1Q99MV1 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tdrd1Q99MV1 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tdrd1Q99MV1 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tdrd1Q99MV1 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tdrd1Q99MV1 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tdrd1Q99MV1 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tdrd1Q99MV1 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tdrd1Q99MV1 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tdrd1Q99MV1 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Tdrd1Q99MV1 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tdrd1Q99MV1 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tdrd1Q99MV1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tdrd1Q99MV1 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Tdrd1Q99MV1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tdrd1Q99MV1 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Tdrd1Q99MV1 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tdrd1Q99MV1 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tdrd1Q99MV1 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tdrd1Q99MV1 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tdrd1Q99MV1 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tdrd1Q99MV1 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tdrd1Q99MV1 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tdrd1Q99MV1 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tdrd1Q99MV1 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tdrd1Q99MV1 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tdrd1Q99MV1 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tdrd1Q99MV1 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tdrd1Q99MV1 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Tdrd1Q99MV1 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Tdrd1Q99MV1 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Tdrd1Q99MV1 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Tdrd1Q99MV1 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tdrd1Q99MV1 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tdrd1Q99MV1 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tdrd1Q99MV1 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tdrd1Q99MV1 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tdrd1Q99MV1 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tdrd1Q99MV1 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tdrd1Q99MV1 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tdrd1Q99MV1 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tdrd1Q99MV1 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tdrd1Q99MV1 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tdrd1Q99MV1 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tdrd1Q99MV1 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tdrd1Q99MV1 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tdrd1Q99MV1 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tdrd1Q99MV1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tdrd1Q99MV1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tdrd1Q99MV1 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tdrd1Q99MV1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd1Q99MV1 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd1Q99MV1 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd1Q99MV1 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd1Q99MV1 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd1Q99MV1 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd1Q99MV1 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd1Q99MV1 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd1Q99MV1 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd1Q99MV1 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms