Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Rcbtb2Q99LJ7 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Rcbtb2Q99LJ7 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Rcbtb2Q99LJ7 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Rcbtb2Q99LJ7 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Rcbtb2Q99LJ7 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Rcbtb2Q99LJ7 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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