Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ciao1Q99KN2 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms