Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pacsin3Q99JB8 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pacsin3Q99JB8 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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