Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Apobec3Q99J72 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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Apobec3Q99J72 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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