Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Slc8b1Q925Q3 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Slc8b1Q925Q3 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Slc8b1Q925Q3 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms