Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Cldn16Q925N4 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Cldn16Q925N4 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Cldn16Q925N4 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Cldn16Q925N4 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms