Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfdQ925I7 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms