Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csmd1Q923L3 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Csmd1Q923L3 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms