Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Trim59Q922Y2 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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Trim59Q922Y2 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Trim59Q922Y2 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Trim59Q922Y2 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Trim59Q922Y2 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Trim59Q922Y2 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim59Q922Y2 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim59Q922Y2 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim59Q922Y2 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim59Q922Y2 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim59Q922Y2 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim59Q922Y2 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim59Q922Y2 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim59Q922Y2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim59Q922Y2 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim59Q922Y2 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim59Q922Y2 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim59Q922Y2 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim59Q922Y2 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim59Q922Y2 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim59Q922Y2 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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