Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms