Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Snx15Q91WE1 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Snx15Q91WE1 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Snx15Q91WE1 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Snx15Q91WE1 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Snx15Q91WE1 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx15Q91WE1 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms