Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms