Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps3Q91VB4 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms