Protein–RNA interactions for Protein: Q8VED5

Krt79, Keratin, type II cytoskeletal 79, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt79Q8VED5 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt79Q8VED5 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt79Q8VED5 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt79Q8VED5 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt79Q8VED5 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt79Q8VED5 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt79Q8VED5 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt79Q8VED5 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt79Q8VED5 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt79Q8VED5 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt79Q8VED5 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt79Q8VED5 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt79Q8VED5 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt79Q8VED5 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt79Q8VED5 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Krt79Q8VED5 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Krt79Q8VED5 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Krt79Q8VED5 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Krt79Q8VED5 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Krt79Q8VED5 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Krt79Q8VED5 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Krt79Q8VED5 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Krt79Q8VED5 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Krt79Q8VED5 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Krt79Q8VED5 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Krt79Q8VED5 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Krt79Q8VED5 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Krt79Q8VED5 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Krt79Q8VED5 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Krt79Q8VED5 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt79Q8VED5 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms