Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Smg8Q8VE18 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Smg8Q8VE18 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Smg8Q8VE18 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Smg8Q8VE18 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Smg8Q8VE18 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Smg8Q8VE18 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Smg8Q8VE18 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Smg8Q8VE18 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Smg8Q8VE18 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
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Smg8Q8VE18 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Smg8Q8VE18 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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