Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDJ3

Hdlbp, Vigilin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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HdlbpQ8VDJ3 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
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HdlbpQ8VDJ3 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HdlbpQ8VDJ3 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HdlbpQ8VDJ3 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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HdlbpQ8VDJ3 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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HdlbpQ8VDJ3 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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HdlbpQ8VDJ3 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HdlbpQ8VDJ3 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HdlbpQ8VDJ3 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HdlbpQ8VDJ3 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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HdlbpQ8VDJ3 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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HdlbpQ8VDJ3 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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HdlbpQ8VDJ3 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HdlbpQ8VDJ3 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HdlbpQ8VDJ3 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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HdlbpQ8VDJ3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HdlbpQ8VDJ3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HdlbpQ8VDJ3 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HdlbpQ8VDJ3 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HdlbpQ8VDJ3 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HdlbpQ8VDJ3 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HdlbpQ8VDJ3 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HdlbpQ8VDJ3 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HdlbpQ8VDJ3 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HdlbpQ8VDJ3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HdlbpQ8VDJ3 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HdlbpQ8VDJ3 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HdlbpQ8VDJ3 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HdlbpQ8VDJ3 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HdlbpQ8VDJ3 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HdlbpQ8VDJ3 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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