Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
Fam20bQ8VCS3 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Fam20bQ8VCS3 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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