Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms