Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Ccdc58Q8R3Q6 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Ccdc58Q8R3Q6 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Ccdc58Q8R3Q6 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Ccdc58Q8R3Q6 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Ccdc58Q8R3Q6 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Ccdc58Q8R3Q6 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Ccdc58Q8R3Q6 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
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Ccdc58Q8R3Q6 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
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Ccdc58Q8R3Q6 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Ccdc58Q8R3Q6 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ccdc58Q8R3Q6 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc58Q8R3Q6 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc58Q8R3Q6 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc58Q8R3Q6 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc58Q8R3Q6 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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