Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Lrrtm1Q8K377 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Lrrtm1Q8K377 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Lrrtm1Q8K377 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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