Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms